有少部分的感染数码兽，恢复成了正常的数码兽。
根据后来的调查，可以发现这些恢复过来的数码兽，都是感染数码兽入侵这段时间里，被感染数据侵蚀的数码兽。
至于那些一早就被感染的数码兽，则是跟以前一样，没有恢复的可能性，最后都是被处理掉后，重生成数码蛋离开了人类世界。
除此之外，在感染数码兽事件结束不到三四天后，世界各地突然出现了大量的数码秘境入口。
根据数码联盟的检测，这些数码秘境都是刚降临到亚空间上的，并且每一个出现的时间都很突兀，完全不符合之前数码秘境降临的规律。
这种奇怪的情况，在再加上之前感染数码兽事件的关系，数码联盟没有让数码驯兽师们第一时间去探索。
决定先放着看看秘境的情况，然后继续处理这次事件遗留下的各种问题。
另外就是数码联盟的创始人之一也归来，并且再一次担任数码联盟总部的副盟主。